Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Tmem54Q9D7S1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tmem54Q9D7S1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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