Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmigd1Q9D7L8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms