Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cldn23Q9D7D7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldn23Q9D7D7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Cldn23Q9D7D7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn23Q9D7D7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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