Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Klhl40Q9D783 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl40Q9D783 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms