Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms