Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fundc2Q9D6K8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fundc2Q9D6K8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms