Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtl8cQ9D6I0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms