Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab11fip1Q9D620 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Rab11fip1Q9D620 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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