Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc7Q9D541 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms