Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms2Q9D4B1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgms2Q9D4B1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sgms2Q9D4B1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sgms2Q9D4B1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgms2Q9D4B1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sgms2Q9D4B1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Sgms2Q9D4B1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Sgms2Q9D4B1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sgms2Q9D4B1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sgms2Q9D4B1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sgms2Q9D4B1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Sgms2Q9D4B1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Sgms2Q9D4B1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms2Q9D4B1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Sgms2Q9D4B1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms2Q9D4B1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sgms2Q9D4B1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sgms2Q9D4B1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sgms2Q9D4B1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Sgms2Q9D4B1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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