Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sohlh2Q9D489 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sohlh2Q9D489 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms