Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Snx29Q9D3S3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx29Q9D3S3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms