Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700034E13RikQ9D2T6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700034E13RikQ9D2T6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms