Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9D2Q3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9D2Q3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms