Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chordc1Q9D1P4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms