Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lmbr1lQ9D1E5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms