Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Susd3Q9D176 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms