Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc3Q9D114 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc3Q9D114 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms