Protein–RNA interactions for Protein: Q9D112

Uncharacterized protein C20orf196 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D112 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q9D112 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q9D112 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D112 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D112 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q9D112 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q9D112 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q9D112 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q9D112 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms