Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Lsm12Q9D0R8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lsm12Q9D0R8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms