Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpsap1Q9D0M1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpsap1Q9D0M1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpsap1Q9D0M1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpsap1Q9D0M1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpsap1Q9D0M1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpsap1Q9D0M1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms