Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Zbed3Q9D0L1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Zbed3Q9D0L1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Zbed3Q9D0L1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbed3Q9D0L1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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