Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gtf2e1Q9D0D5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf2e1Q9D0D5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms