Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pbdc1Q9D0B6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pbdc1Q9D0B6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms