Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mms19Q9D071 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms