Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc47Q9D024 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc47Q9D024 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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