Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
2610524H06RikQ9CZU9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610524H06RikQ9CZU9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610524H06RikQ9CZU9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610524H06RikQ9CZU9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610524H06RikQ9CZU9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610524H06RikQ9CZU9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610524H06RikQ9CZU9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
2610524H06RikQ9CZU9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms