Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Shmt2Q9CZN7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Shmt2Q9CZN7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms