Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Klhl35Q9CZ49 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Klhl35Q9CZ49 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms