Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gtpbp8Q9CY28 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gtpbp8Q9CY28 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gtpbp8Q9CY28 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gtpbp8Q9CY28 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gtpbp8Q9CY28 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gtpbp8Q9CY28 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp8Q9CY28 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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