Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mis12Q9CY25 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mis12Q9CY25 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms