Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bud23Q9CY21 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Bud23Q9CY21 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Bud23Q9CY21 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Bud23Q9CY21 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Bud23Q9CY21 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Bud23Q9CY21 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bud23Q9CY21 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms