Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CXL3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Q9CXL3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CXL3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms