Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Nip7Q9CXK8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nip7Q9CXK8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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