Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prdm5Q9CXE0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Prdm5Q9CXE0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms