Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Psmd8Q9CX56 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms