Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RpainQ9CWY9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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