Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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