Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ndufaf1Q9CWX2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ndufaf1Q9CWX2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms