Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cxxc1Q9CWW7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms