Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prkrip1Q9CWV6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms