Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Q9CWU4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Q9CWU4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q9CWU4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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