Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms