Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
4930524J08RikQ9CUJ5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
4930524J08RikQ9CUJ5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms