Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4930553M12RikQ9CUH1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms