Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp13a2Q9CTG6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atp13a2Q9CTG6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms