Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rprd1bQ9CSU0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rprd1bQ9CSU0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms