Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9CRW3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CRW3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms