Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psmd9Q9CR00 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms