Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Atg12Q9CQY1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms